Take se copi i dati che ti interessano a mano, e soltanto quelli, dovrai reinstallare tutti i programmi ( io lo consiglio, fai una bella pulizia e ne gioverai in prestazioni )
Se usi un programma per fare backup puoi farglielo fare tramite file immagine e quindi ti fa un duplicato dello stato attuale del tuo hd , oppure selettivo tramite cartelle che hai selezionato e vuoi salvare ;)